WinMX 3.1だったら「Width Changer」というツールで直せたのですが
どうやら「Width Changer」はWinMX 3.1にしか対応していないようです。
WinMX 3.29Betaが出ているとき、某氏がFrontcode宛に英文で設定ウィンドウの右端について
メールを送信したそうですが、返事がこなかったみたいです。
ダウンロードページから設定ウィンドウの右端修正版をダウンロードできます。